Нанопоры в молекулярной биологии
| Автор | Сообщение |
| PIROL | #3216 18-01-2011 23:06 GMT |
4 сообщений |
Нанопоры в молекулярной биологии. Идея использования естественной нанопоры альфа-гемолизина для секвенирования биополимеров была предложена Хаганом Бэйли 15 лет назад. Десятки исследователей по всему миру бросились разрабатывать эту тему, но постепенно поутих ажиотаж, возникший по поводу прихода новой эры в молекулярной биологии, по-прежнему рулит Сэнгер. В работе описаны перепитии борьбы нового со старым, много иллюстраций и свежих ссылок. Обозначен новый прорыв в технологии нанопор силами компаний IBM и Roche. |
| ondatr | #3217 19-01-2011 08:57 GMT |
|
459 сообщений |
>по-прежнему рулит Сэнгер. Разве? Казалось, Сэнгер за тихоходностью потихоньку уходит в музей, а рулит пиросиквенирование. |
| PIROL | #3219 19-01-2011 21:25 GMT |
|
4 сообщений |
Quote Вот как раз им и занимается фирма «454 Life Scences Corp”, а фирма эта входит в корпорацию Roche, которая заключила контракт с IBM на разработку чипа на нанопорах. Об этом я и пишу в подборке, на которую идет ссылка. Вообще приборы для сиквенирования безумно дороги, поколения техники меняются быстро, и каждый работает на том, что есть. Вот появится обещенный чип и все это железо отправится на помойку. |
| ondatr | #3328 20-02-2011 13:45 GMT |
|
459 сообщений |
Патриотизьм - штука хорошая, хотя я даже потенциально (по бюджету) не потребитель этой продукции. Для меня даже секвенировать по-Сангеру - (хорошо бы, недалекое) будущее, да что там секвенировать - даже просто PCRить. Но сейчас, imho, прогресс в быстром секвенировании должен сместиться в сторону удлинения размеров читаемых последовательностей - поелику возможный для нормальной реконструкции минимум уже достигнут. И если нанопоры этому смогут помочь - я рад за Вас. |
| PIROL | #3390 01-03-2011 21:25 GMT |
|
4 сообщений |
Quote Как раз эти проблемы и решаются. Нанопора, захватив цепочку, анализирует (читает) ее до конца или докакой-то технологической помехи. Другие нанопоры (в чипе ведь целая матрица) дублирует работу. Предварительно ДНК разбивается на макрокуски. Программная сборка общего текста очень проста. Что касается цены и доступности, то на то он ичип, чтобы быть дешевым. Дополнительного дорогостоящего оборудования и реактивов не потребуется, разве, что ПО для компьютера |
Личное сообщение
